Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms