Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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GGTLC3B5MD39 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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GGTLC3B5MD39 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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GGTLC3B5MD39 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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GGTLC3B5MD39 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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GGTLC3B5MD39 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GGTLC3B5MD39 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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