Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFIP11Q9UBB9 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms