Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms