Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms