Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms