Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HECW1Q76N89 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms