Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC174Q6PII3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms