Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SDK2Q58EX2 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms