Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSPP1Q1MSJ5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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