Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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