Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PMS2P11Q13670 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms