Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CUL4BQ13620 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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