Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNRPFP62306 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPFP62306 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPFP62306 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPFP62306 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPFP62306 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPFP62306 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPFP62306 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPFP62306 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPFP62306 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPFP62306 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPFP62306 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPFP62306 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNRPFP62306 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms