Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SLIT2-201ENST00000273739 5132 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ASPH-208ENST00000517856 6337 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TIAM2-203ENST00000360366 5771 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ESR1-207ENST00000440973 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms