Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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