Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AQP4P55087 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AQP4P55087 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AQP4P55087 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AQP4P55087 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AQP4P55087 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AQP4P55087 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AQP4P55087 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms