Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRCA2P51587 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms