Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms