Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
NMUP48645 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NMUP48645 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms