Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRCC3P46736 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms