Protein–RNA interactions for Protein: P30520

ADSS, Adenylosuccinate synthetase isozyme 2, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADSSP30520 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ADSSP30520 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ADSSP30520 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms