Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PEX2P28328 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PEX2P28328 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PEX2P28328 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PEX2P28328 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PEX2P28328 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms