Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB2P26583 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB2P26583 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms