Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA6P23229 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms