Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms