Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms