Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1RP00736 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1RP00736 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms