Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms