Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms