Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3CA6NKF2 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms