Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms