Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL11Q9NVR0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms