Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FANCFQ9NPI8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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