Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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