Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM175Q9BSA9 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM175Q9BSA9 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms