Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RNF185Q96GF1 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RNF185Q96GF1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms