Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C18orf8Q96DM3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms