Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TDRD12Q587J7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD12Q587J7 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms