Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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HERC3Q15034 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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