Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms