Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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