Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CUL3Q13618 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms