Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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TCOF1Q13428 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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TCOF1Q13428 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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TCOF1Q13428 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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TCOF1Q13428 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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TCOF1Q13428 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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TCOF1Q13428 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TCOF1Q13428 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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TCOF1Q13428 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TCOF1Q13428 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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TCOF1Q13428 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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TCOF1Q13428 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TCOF1Q13428 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TCOF1Q13428 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCOF1Q13428 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCOF1Q13428 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCOF1Q13428 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TCOF1Q13428 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TCOF1Q13428 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TCOF1Q13428 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TCOF1Q13428 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
TCOF1Q13428 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TCOF1Q13428 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
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