Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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