Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SCGB2A2Q13296 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SCGB2A2Q13296 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCGB2A2Q13296 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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SCGB2A2Q13296 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SCGB2A2Q13296 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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SCGB2A2Q13296 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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SCGB2A2Q13296 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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SCGB2A2Q13296 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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SCGB2A2Q13296 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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