Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HTD2P86397 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HTD2P86397 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HTD2P86397 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HTD2P86397 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HTD2P86397 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HTD2P86397 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HTD2P86397 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HTD2P86397 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HTD2P86397 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HTD2P86397 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
HTD2P86397 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
HTD2P86397 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
HTD2P86397 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
HTD2P86397 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
HTD2P86397 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
HTD2P86397 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HTD2P86397 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
HTD2P86397 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
HTD2P86397 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms