Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SSBP2P81877 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SSBP2P81877 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms