Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SH3BGRP55822 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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