Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HADHBP55084 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HADHBP55084 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HADHBP55084 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms